品牌办学：再次走上改革之路
在走过了规范办学、特色办学这两个阶段后，王君健将思考的重心放在了品牌办学上。而品牌办学更重要的是体现在学校如何走向变革和转型。
“变革的基本趋势是走向扁平化、低重心。”坪山实验学校一直在探索实施“扁平化-矩阵式”管理，“扁平化-矩阵式”管理，由于层级少，信息的传递速度快，从而达到高层能尽快发现信息所反映的问题，并及时采取相应的解决措施；同时，由于信息传递经过的层次少，传递过程中失真的可能性小。
同时，坪山实验学校开启了制度重构，理清制度管理要求的价值取向：即以尊重为前提，给教职工在遵循制度要求的过程中留下创造发挥的空间，用制度来引导、激发全体师生员工的工作激情，使其不断迸发出工作智慧。学校来重新制定各项制度，包括教师成长制度、学生发展制度、行政服务制度、后勤保障制度、课程建设制度、重大事项决策制度、职称改革制度和学部管理制度系列等。
在教育的征途上，总有人要成为“摘星星的人”。七年间，坪山实验学校从白手起家走上了坪山基础教育的制高点，实现了深圳东部教育的“实验梦”，点燃了百姓对教育的期望，成为区域教育改革的典范，也为全国同类实验学校的办学提供了可资借鉴的经验。
作为一校之长，王君健的观念总是最新的，以至于老师们总是感叹：“校长太快了，我们永远追不上他！”这种超前意识来自于“办一所理想学校”的强烈责任感，来自于深圳创新之城的城市文化氛围，也来自于他本人坚持阅读和写作的教育行走方式。“一所学校拥有高素质的学生，拥有一大批耀眼的名师，才是真正的成功。我们要继续行走，为实现‘学校有书香，教师有智慧，学生有灵性，具有实验性、示范性的深圳一流名校’的办学目标而追求不息！”