发源于深圳羊台山北麓的茅洲河，在沙井街道及东莞长安镇交界处汇入伶仃洋，河长41.61公里，其下游11.4公里为深莞两市界河。流域面积 398.13平方公里，其中深圳市境内面积310 .85平方公里。茅洲河流经深圳的宝安沙井、松岗和光明新区以及东莞的长安镇。

深圳市水务局相关负责人2011年参加《民心桥》节目时坦言，茅洲河已是深圳最黑臭河流。且沙井一带防洪能力非常脆弱，前几年，由于没建泵站等临时措施，近乎逢雨必涝。

作为深圳河流水环境最差的茅洲河，由于属感潮河段治理难度大，流域内污染源众多，河水黑臭，河道淤积严重，汛期流域内洪涝灾害频发。

广东省环保厅监测显示，该河干流和15条主要支流水质均劣于Ⅴ类，堪称“珠三角污染最严重的河流”。